home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00468 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  38 lines
  1. ****************************************************************
  2. * Respiratory-chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature *
  3. ****************************************************************
  4.  
  5. Respiratory-chain NADH dehydrogenase (EC 1.6.5.3) [1,2] (also known as complex
  6. I  or  NADH-ubiquinone  oxidoreductase) is  an  oligomeric  enzymatic  complex
  7. located  in  the inner mitochondrial membrane  which  also  seems  to exist in
  8. the chloroplast and in cyanobacteria (as a NADH-plastoquinone oxidoreductase).
  9. Among the 25 to 30 polypeptide  subunits  of  this bioenergetic enzyme complex
  10. there is  one  with a  molecular  weight  of 30 Kd (in mammals) which has been
  11. found to be:
  12.  
  13.  - Nuclear encoded, as a precursor form with a transit peptide in mammals, and
  14.    in Neurospora crassa.
  15.  - Mitochondrial  encoded in  Paramecium (protein P1), and in the  slime  mold
  16.    Dictyostelium discoideum (ORF 209).
  17.  - Chloroplast encoded in various higher plants (ORF 159).
  18.  
  19. It is also present in bacteria:
  20.  
  21.  - In the cyanobacteria Synechocystis strain PCC 6803 (ORF 155).
  22.  - Subunit C of Escherichia coli NADH-ubiquinone oxidoreductase (gene nuoC).
  23.  - Subunit NQO5 of Paracoccus denitrificans NADH-ubiquinone oxidoreductase.
  24.  
  25. This protein, in its mature form,  consists of  from  157  to  266  amino acid
  26. residues.  The  best conserved region is located in the C-terminal section and
  27. can be used as a signature pattern.
  28.  
  29. -Consensus pattern: E-R-E-x(2)-[DE]-[LIVMF](2)-x(6)-[HK]-x(3)-[KR]-x-[LIVM](2)
  30. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32. -Last update: June 1994 / Text revised.
  33.  
  34. [ 1] Ragan C.I.
  35.      Curr. Top. Bioenerg. 15:1-36(1987).
  36. [ 2] Weiss H., Friedrich T., Hofhaus G., Preis D.
  37.      Eur. J. Biochem. 197:563-576(1991).
  38.